Signature G nomique de 3 cotypes d'Ostreococcus, Algues Prasinophytes

Le genre Ostreococcus regroupe les plus petits organismes eucaryotes photosynthétiques connus ŕ ce jour. Les génomes complets de 3 écotypes d'Ostreococcus, isolés ŕ partir de 3 niches écologiques différentes, ont été séquencés. Ces écotypes correspondent ŕ une souche de surface adaptée ŕ une forte luminosité, une souche profonde adaptée ŕ une faible luminosité, et une souche de surface polyvalente ŕ la lumičre. La comparaison des génomes a révélé une divergence en acides aminés inattendue entre les gčnes orthologues (70% d'identité) alors que leurs séquences 18S ont une identité de 99%. La divergence entre ces 3 souches a été comparée avec les divergences de 4 lignées eucaryotes, et souligne le fait que le gčne marqueur 18S sous-estime la divergence globale des organismes unicellulaires. La comparaison génomique des 3 Ostreococcus a permis d'identifier les fonctions des gčnes orthologues et des gčnes spécifiques. L'estimation des taux de substitution entre orthologues a permis d'identifier des gčnes candidats ŕ l'origine de l'adaptation de ces organismes ŕ leur environnement, et suggčre un rôle majeur des protéines transmembranaires dans l'évolution de ces espčces.